La struttura di Soleterre prevede tre funzioni principali: decisionali, operative e di controllo.
Per regolamentare la distinzione tra le varie funzioni l’organizzazione è dotata di statuto, regolamenti e organigramma. Gli organi statutari determinano le decisioni e le linee strategiche di conduzione della Fondazione e sono responsabili delle attività e del controllo dei risultati economico-finanziari e di utilità sociale rispondenti alla mission.